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2006.12.08
カテゴリ：生命科学
今日は午前中は東工大のO先生主催のBIRD会議、午後はその流れで
BIRDメンバーやその他の国内選りすぐり精鋭部隊の人たちの 「Post CASP7 workshop-GSIC symposium」に参加した。 それにしても今回のCASPも日本勢の大健闘が目立つ。 CBRCのN先生のプログラムpoodleがディスオーダー予測で強さ を誇り好成績をおさめる。北里のU先生のチームは。それぞれに微妙に手法をかえた 複数のチームで参戦し、おたがいのスコアを比較することで、どの 手法がもっともクリティカルだったのかを相互検証しながら、新しい 方法論を開発する、という念の入った方策。 医科研のI先生のチームはSVMを巧妙に利用して、同じくディスオーダー予測で 好成績をおさめる。 そしてCBRCのT師匠（とO先生）のチーム、いくつかのFORTE改と 自動化フロントエンドと新規実装のfront endが冴え渡り、ドメイン 境界予測において（但し書きつきではあるが）世界一・・・！！！ T師匠、おめでとう！！ ということで、新年早々にもT師匠には某雑誌のinvited review を一緒に執筆することにしたのであった。 ともあれ、こういうセミナーをきいていると、それなりに新しい方法論や 試したいアイデアが次々とわいてきて、それはそれで、非常にやる気が 出るのである。うちから参加した他の人々も、なにかアイデアを学んでくれたら いいなあ。 Piyotaも頑張らなければ！！がんばるぞ～。 ということでいくつか埋もれてしまう前にアイデアを。 １．まずは今回話題になっていた２ＨＧ６：ＰＤＢ これについてはちょっとさあ。って 感じ。ここには詳しくはかけないけど。昨日提出したプチ申請書の企画の時に使って みようかな。 ２．ところで多くの蛋白質が生合成時にＮ末端からfoldしていくのがある程度 義務づけられているのであれば、ドメイン境界とcodon usageには何らかの相関が あるんでしょうかね？気が向いたら調べてみることにする。 ３．年始のどこかの時期に産総研におじゃましてN先生らと作戦会議するのが いいんじゃないかとおもうのだけれども、その時にT師匠にT-coffeeについて 伝授してもらうことにする。 ４．そういえば医薬基盤研のM先生に会場で会えたのもうれしかったなあ。 来年早々に基盤研にお邪魔しますので、進捗状況なんかはそのときに。 それにしても東工大の大岡山キャンパス、いちょうの巨木がいいかんじに 黄色い枯れ葉を散らしていて、大学らしくていい感じであった。 お気に入りの記事を「いいね！」で応援しよう
最終更新日
2006.12.08 23:44:17
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