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サウザーの強烈な一撃でゼロワンメタルクラスタホッパーはようやく変身を解除。ダメージを受けた或人（演：高橋文哉）は、垓（演：桜木那智）の「あなたはヒューマギアによって破滅する」という言葉にショックを受け、そのまま意識を失ってしまう。そして、勝ち誇る垓のもとに「アークの意志に触れた」と言うエンジ（演：崎本大海）が近づいて…。
ようやく意識を取り戻した或人の前に、復元されたマッチ（演：馬場良馬）が現れた。実はマッチは、千春（演：小宮有紗）と二階堂（演：ガイモン）を結びつけるためにわざと暴走したらしい。胸をなで下ろす或人だが、メタルクラスタキーのダメージが大きい。イズ（演：鶴嶋乃愛）はそんな或人をDr.オミゴト（演：高橋光宏）にまかせると、すべてのヒューマギアに呼びかけ、ある作戦を実行に移す。
エイムズ本部では、拘束された滅（演：砂川脩弥）が、諫（演：岡田龍太郎）に「いずれ全てのヒューマギアが、アークの意志に従う日がくる」と予告をする。「俺は俺のルールで動く」と言い返す諫だが、滅は「なぜ言い切れる？」と不気味な笑いを浮かべて諫を見下す。
最強匠親方（演：長江英和）と宇宙野郎昴（演：桑畑亨成）は、滅亡迅雷.netのアジトで飛電メタルとメタルクラスタキーのデータを入手。データを受け取ったイズは、再びすべてのヒューマギアに、メタルクラスタキーを構成するアークの悪意のデータを打ち消すため、善意のデータが必要と訴える。ヒューマギアたちの或人を思う気持ちはジョブキーとなって現れ…。
最強匠親方らがデータを入手したのは、実は垓に近づいたエンジの働きによるものだった。エンジに騙されていたことを知った垓は激怒。エンジにゼツメライズキーを装着、アルシノマギアとして暴走させ、自らはサウザーに変身。アルシノマギアを攻撃する。
アルシノマギア＝エンジを救おうと或人が現れた。イズの「変身してください！」の声に迷う或人だったが、「ヒューマギアを信じてください」というイズに意を決してゼロワンメタルクラスタホッパーに変身する。
変身直後は苦しむ或人だったが、みごとにその力を制御。さらにイズからヒューマギアたちの善意で作られた武器プログライズホッパーブレードを受け取り、意気揚々とサウザーに立ち向かう。
ゼロワンメタルクラスタホッパーはサウザーを圧倒。さらにプログライズホッパーブレードでアルシノマギアをエンジへと戻してしまった。ヒューマギアの力を信じたからこそ手に入れたパワー…。メタルクラスタホッパーはサウザーを粉砕、変身解除へと追い込む。
プログライズホッパーブレードでヒューマギアの暴走も抑えることができた。ヒューマギアの契約件数も再び持ち直し、或人は「やっぱりヒューマギアは夢のマシンだ」とイズの前で決意を新たにする。
しかし、エイムズの本部では、滅の姿が消えていた。いったい何が、どうなっているのか…!?