FIVE PRIME 〜神経遺伝学とバイオインフォマティクス〜

今日はUCSC Genome Browserを使用したプライマー設計の方法を紹介します。


①UCSC Genome Browserを開き、Genome Browserをクリック




②目的の遺伝子名を入力します。ここでは家族性パーキンソン病の原因遺伝子のSNCAとしています。




③transcript variantが表示されます。目的の遺伝子であればどれをクリックしても大丈夫です。




④transcript variantの中で、最もexonが多いものをクリックします。




⑤Exon Primerをクリックします。




⑥パラメータを入力し、submitをクリックします。




⑦exonごとにプライマーが作成されています。