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2006.11.30
カテゴリ：生命科学
ここ数日，書き物の合間をぬって配列情報解析＆ドメインハンティングに 注力を再開した．まあ，なぜかといわれると一つには，そろそろ新しい タンパク質の立体構造解析がやりたいので，小さめの素適なNMR試料が ほしいからである．でもって，本来ならそろそろ一個くらい大学院生 A君（彼は最近めきめき腕をあげていて，クローン→発現条件検討 までノーミスで2週間を切るようになってきた）の狙っているサンプルから 新しいドメイン試料があがってきそうなのであるが，マーフィーの第４法 則にはまってしまっているようで，いい試料がとれないのである． ちなみにここでいうマーフィーの第４法則とは， 「生物学的に面白いタンパク質はたいがい性質が悪い」 である． 閑話休題． というわけで，これまで手がけていたエンドソーム系から，MT系の MITドメインにシフトしてみようと思い，以前発現に失敗している Spastin / Spartinの解析を再開したのだが． Spastin / SpartinはそもそもCicarrieriらが最初にMITドメイン発見の もととなった蛋白質ではあるが，EMBLとEBIでは扱いに温度差があるよう だ．SpastinのMITドメインはSMARTでは見つかってもPfamでは見つから ない．Spartinに至っては，どちらのサーバーでも閾値以下である． FORTEで探してやるとようやく見つかるが，それもかなりドメイン境界 を絞ってやらないと見つけてくれない．こいつら，本当にMITドメインな のか，大丈夫なのかちょっと心配になる． SさんのD論の推移を見守りながら，この間アクセプトになった２報の 論文のCopy right transferやらoffprint order formやらをやっつける． NIさんの論文のProofも行う．Springerのcorrection team centerって いまはインドにあるんですね～． Faculty1000をじっくり見ていたら，確かに面白い論文がみつかった． これ（PMID: 16954350）です．これってどうなんでしょう？ ともあれFaculty1000は確かに面白い． お気に入りの記事を「いいね！」で応援しよう
最終更新日
2006.12.01 02:04:28
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