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2006.12.04
カテゴリ：生命科学
ひさしぶりに締め切りに追われる書類のない日々が戻ってきた． ので，やりかけのNMRの立体構造計算にとりくむことにする． まず問題点は，15N-edited noesyと13C-edited noesyにおける peakのシグナル位置のずれ．残基内NOEを自動的に発生するスクリプトを 書いて，sparkyを立ち上げて，sparkyのpeak centre機能を使って 微調整し，それをcyanaの*.protファイルに反映させる，という方法をとる． その後再計算を行い，アサインメントされない（おそらくノイズを多く 含む）ピークを一時的に消去して，さらに再計算を行う． すると1st cycle target function 185,final taeget function 0.83, rmsd 0.88 というまずまずの結果がでた． なお午後は，阪大蛋白研のN先生の大学院生向きの講義があったので， それを聞きにいくことにした．いろいろ研究で煮詰まったら，バイオインフ ォマティクスの勉強をする，というのが個々最近のPiyotaのトレンドで ある． お気に入りの記事を「いいね！」で応援しよう
最終更新日
2006.12.05 01:53:36
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